1954年7月15日，昌吉回族自治区成立，辖乌鲁木齐、昌吉、米泉三县。

1955年3月11日，改名为昌吉回族自治州。

1955年，昌吉州人民卫生院成立，1956年更名为昌吉州人民医院。

1956年，修建的延安北路，是昌吉历史上第一条沥青道路。

1956年，昌吉州俱乐部成立。

1956年5月21日至31日，中国共产党昌吉回族自治州第一次代表大会在昌吉召开。

1958年，玛纳斯、呼图壁、奇台、吉木萨尔、阜康、木垒等县划归昌吉州管辖；中共昌吉州委机关报——《昌吉报》创刊；昌吉回族自治州第一个人民公社——木垒哈萨克自治县东风人民公社成立。

1959年，乌鲁木齐县划归乌鲁木齐市管辖；昌吉州第一所中专学校，昌吉师范学校成立；昌吉州第一座百货大楼，昌吉百货大楼建成；昌吉州第一个工业基地，天龙钢铁厂建成投产，甘河子工业基地初见规模。

1961年，呼图壁大海子水库竣工蓄水，库容量4000万立方米，是当时昌吉州第一个渔业基地。

1963年，昌吉州粮食总产达4.3亿斤，比建州前增长近两倍。

1964年，昌吉州农业机械达300台。

1974年，昌吉州举办首届篮球赛。

1975年，昌吉回族自治州汽车运输公司成立。

1978年，昌吉州科协第一次代表大会召开，迎来“科学的春天”。

1982年，昌吉州在农村实行家庭联产承包责任制。

1983年后，昌吉县、阜康县、米泉县先后撤县设市。

1985年，昌吉棉纺织厂建成，是当时全疆首屈一指的棉纺龙头企业。

1985年10月15日，新疆最大的人畜饮水灌溉人工草场干渠——玛纳斯县南山团结干渠建成通水，昌吉州第一个现代化牧业基地玛纳斯旱卡子滩牧业基地奠基。

1986年开始，昌吉州大力推动牧民定居。

1989年，昌吉飞马转盘建成。

1990年，昌吉州首家中外合资企业——昌隆白水泥有限公司成立。

1992年，乌拉斯台口岸开关；“亚运之光”火炬在昌吉州传递。

1992年8月15日，首届新疆昌吉瑶池蟠桃会开幕。这是昌吉州第一次融文化艺术、经济交流于一体的会展活动。

1993年，新疆西域种子公司成立；新疆特变电工股份有限公司成立。

1994年，呼图壁县提出“赶着黄牛奔小康”，养牛业快速发展。

1995年，新疆证券公司昌吉营业部开业。

1996年5月14日，昌吉州首家企业集团——昌吉建设集团总公司成立，标志着昌吉在建立现代企业制度，走集约化经营的道路上迈出了可喜的一步。

1996年7月2日，新疆屯河股票正式在上海证券交易所上市。

1996年7月31日，新疆特种变压器制造股份有限公司产品在国际市场竞争中一炮打响，变压器首次出口马来西亚。

1997年，昌吉州技工学校成为国家级重点技校。

1998年8月20日，新疆第一条高速公路——吐乌大高速公路正式建成通车，其中100多公里途经昌吉州。

1999年，中粮屯河投产。

2000年，玛纳斯塔西河石门子水库建成，在工程技术上创造四项世界第一。

2001年，昌吉职业技术学院挂牌。这所学校是昌吉州所辖第一个公办全日制普通高等职业院校。

2002年，中国科学院——天山北坡经济带科技合作昌吉洽谈会举行，这是昌吉州历史上第一次科技合作洽谈会。

2003年，昌吉学院挂牌，成为昌吉州第一所本科院校。

2004年，昌吉州实现中国名牌零突破。在9月1日举行的中国名牌暨质量管理先进表彰大会上，特变电工新缆厂生产的“新特”牌电缆和天山面粉（集团）有限责任公司生产的“天山”牌面粉荣获“中国名牌”产品称号。

2006年，奇台恐龙沟恐龙化石挖掘，发现世界第二、亚洲第一的马门溪龙化石。

2007年，米泉市并入乌鲁木齐市，撤销米泉市；秋季开学，全州义务教育阶段学生学杂费全免；天山天池景区成功创建为“全国首批5A景区”。

2008年6月19日，北京奥运火炬在昌吉传递。

2009年，昌吉州实现乡乡通柏油路。

2010年，特变电工跻身中国企业500强。

2011年，“在全疆率先实现农牧民人均纯收入整体超万元”目标实现，昌吉州农牧民人均纯收入达10166元。

2012年，国务院批准设立国家级新疆准东经济技术开发区。

2013年6月21日，在第37届世界遗产大会上，托木尔、喀拉峻—库尔德宁、巴音布鲁克、博格达4个片区以“新疆天山”名称入列世界自然遗产，成为中国第44处世界遗产。

2014年，昌吉州成功创建为第一个“全国民族团结进步创建活动示范州”。

2014年6月22日，在第38届世界遗产大会上，北庭故城遗址作为“丝绸之路：长安—天山廊道路网”中的一处遗址点被列入《世界遗产名录》。

2015年，昌吉州在全疆率先实现县县通高速、乡乡通油路、村村通公路。

2016年，昌吉州在全疆率先推广农业生产卫星导航作业系统。

2017年5月7日，昌吉州在全疆率先颁布施行了《昌吉回族自治州全民参与公益活动条例》，将每年5月的第一个星期日定为“全民参与公益活动日”。

2018年，国务院批复建设乌昌石国家自主创新示范区，这是全国第20个获批的示范区。

2019年7月12日,新疆首个以煤炭为主题的能源馆在新疆准东经济技术开发区建成开馆。

2019年11月28日，全国首批“枫桥式公安派出所”命名仪式在北京举行，昌吉市公安局建国路派出所成为全国首批100个“枫桥式公安派出所”之一。

2020年5月5日，2019年度全国十大考古新发现结果正式揭晓，新疆奇台石城子遗址位列其中。

2021年12月30日，全疆首个“行走的医院”项目落地吉木萨尔县。

2022年，昌吉国家农业高新技术产业示范区经国务院批准成为国家级农高区，前身是2002年设立的昌吉国家农业科技园区。这是全疆唯一建设的国家农业高新技术产业示范区。

2022年6月20日，在位于昌吉市北京南路的特变电工股份有限公司，国家工业互联网标识解析二级节点（新疆）正式接入国家顶级节点，标志着新疆首个国家工业互联网标识解析二级节点正式上线。

2022年7月15日，江布拉克景区成功获评国家5A级旅游景区。

2023年7月28日，天山北麓葡萄酒产区产品正式入驻香港优质葡萄酒交易所，天山北麓葡萄酒（香港）推广营销中心揭牌成立，此事件被中国酒业协会纳入影响中国近现代葡萄酒发展重大历史事件白皮书。

2023年8月25日，中国罐头工业协会首届番茄节在昌吉州举行。

2023年12月10日，玛纳斯县在全疆率先成立数字农业产业研究中心。

2024年1月15日，将淖（将军庙至淖毛湖）铁路开通运营，“疆煤外运”再添新通道。

2024年8月8日，奇台江布拉克机场正式通航，这是昌吉州首座民用运输机场。